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堀 弘幸ホリ ヒロユキ

所属部署
大学院理工学研究科 物質生命工学専攻
職名教授
メールアドレス
ホームページURLhttp://www.ach.ehime-u.ac.jp/bchem/
生年月日
Last Updated :2017/11/08

研究者基本情報

学歴

  • 1985年04月 - 1989年03月, 東京大学, 工学系研究科, 工業化学専攻
  • 1983年04月 - 1985年03月, 東京大学, 農学系研究科, 農芸化学専攻
  • 1981年04月 - 1983年03月, 東京大学, 農学部, 農芸化学科

経歴

  •   2007年04月,  - 現在, 愛媛大学, 理工学研究科, 教授
  •   2000年04月,  - 2007年03月, 愛媛大学, 理工学研究科, 助教授
  •   1993年04月,  - 2000年03月, 日本医科大学, 医学部, 助手
  •   1989年04月,  - 1990年03月, 三菱化学生命科学研究所, 特別研究員

所属学協会

  • アメリカ生化学・分子生物学会
  • 日本生化学会
  • 日本分子生物学会
  • 日本RNA学会

委員歴

  •   2014年04月 - 2016年03月, 日本RNA学会, 評議員
  •   2012年07月 - 2014年03月, 日本RNA学会, 集会幹事・第15回日本RNA学会年会長
  •   2007年04月 - 2013年03月, 日本生化学会, 生化学誌・編集委員

研究活動情報

研究分野

  • 機能生物化学
  • 生体関連化学
  • 構造生物化学

研究キーワード

    RNA, フラビン, tRNA, RNA修飾, RNAメチル化酵素, RNA修飾酵素, RNA成熟, RNAプロセシング, 翻訳, 無細胞翻訳系

論文

  • Long and branched polyamines are required for maintenance of the ribosome, tRNAHis and tRNATyr in Thermus thermophilus cells at high temperatures.
    Nakashima M, Yamagami R, Tomikawa C, Ochi Y, Moriya T, Asahara H, Fourmy D, Yoshizawa S, Oshima T, Hori H, Genes to Cells, 22, (7) 628 - 645,   2017年05月
  • Transfer RNA methyltransferases with a SpoU-TrmD  (SPOUT) fold and their modified nucleosides in  tRNA.
    Hori H, Biomolecules, 7, (1) ,   2017年02月
  • Folate-/FAD-dependent tRNA methyltransferase from Thermus thermophilus regulates other modifications in tRNA at low temperatures.
    Yamagami R, Tomikawa C, Shigi N, Kazayama A, Asai SI, Takuma H, Hirata A, Fourmy D, Asahara H, Watanabe K, Yoshizawa S, Hori H, Genes to Cells, 21, (7) 740 - 754,   2016年07月
  • Structural and functional analyses of the archaeal tRNA m2G/m22G10 methyltransferase aTrm11 provide mechanistic insights into site specificity of a tRNA methyltransferase that contains common RNA-binding modules.
    Hirata A, Nishiyama S, Tamura T, Yamauchi A, Hori H, Nucleic Acids Research, 44, (13) 6377 - 6390,   2016年07月
  • Effects of polyamines from Thermus thermophilus, an extreme-thermophilic eubacterium, on tRNA methylation by tRNA (Gm18) methyltransferase (TrmH).
    Hori H, Terui Y, Nakamoto C, Iwashita C, Ochi A, Watanabe K, Oshima T, Journal of Biochemistry, 159, (5) 509 - 517,   2016年05月
  • Multisite-specific archaeosine tRNA-guanine transglycosylase (ArcTGT) from Thermoplasma acidophilum, a thermo-acidophilic archaeon.
    Kawamura T, Hirata A, Ohno S, Nomura Y, Nagano T, Nameki N, Yokogawa T, Hori H, Nucleic Acids Research, 44, (4) 1894 - 1908,   2016年02月
  • In vitro dihydrouridine formation by tRNA dihydrouridine synthase from Thermus thermophilus, an extreme-thermophilic eubacterium.
    Kusuba H, Yoshida T, Iwasaki E, Awai T, Kazayama A, Hirata A, Tomikawa C, Yamagami R, Hori H, Journal of Biochemistry, 158, (6) 513 - 521,   2015年12月
  • Improved solid-phase DNA probe method for tRNA purification: large-scale preparation and alteration of DNA fixation.
    Kazayama A, Yamagami R, Yokogawa T, Hori H, Journal of Biochemistry, 157, (5) 411 - 418,   2015年05月
  • Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI).
    Takuma H, Ushio N, Minoji M, Kazayama A, Shigi N, Hirata A, Tomikawa C, Ochi A, Hori H, Journal of Biological Chemistry, 290, (9) 5912 - 5925,   2015年02月
  • Transfer RNA methyltransferases from Thermoplasma acidophilum, a thermoacidophilic archaeon.
    Kawamura T, Anraku R, Hasegawa T, Tomikawa C, Hori H, International Journal of Molecular Sciences, 16, (1) 91 - 113,   2014年12月
  • Methylated nucleosides in tRNA and tRNA methyltransferases.
    Hori H, Frontiers in Genetics, 5,   2014年05月
  • Distinct tRNA modifications in the thermo-acidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum.
    Tomikawa C, Ohira T, Inoue Y, Kawamura T, Yamagishi A, Suzuki T, Hori H, FEBS Letters, 587, (21) 3575 - 3580,   2013年11月
  • The catalytic domain of topological knot tRNA methyltransferase (TrmH) discriminates between substrate tRNA and nonsubstrate tRNA via an induced-fit process.
    Ochi A, Makabe K, Yamagami R, Hirata A, Sakaguchi R, Hou YM, Watanabe K, Nureki O, Kuwajima K, Hori H, Journal of Biological Chemistry, 288, (35) 25562 - 25574,   2013年08月
  • Degradation of initiator tRNAMet by Xrn1/2 via its accumulation in the nucleus of heat-treated HeLa cells.
    Watanabe K, Miyagawa R, Tomikawa C, Mizuno R, Takahashi A, Hori H, Ijiri K, Nucleic Acids Research, 41, (8) 4671 - 4685,   2013年04月
  • The tRNA recognition mechanism of folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO).
    Yamagami R, Yamashita K, Nishimasu H, Tomikawa C, Ochi A, Iwashita C, Hirata A, Ishitani R, Nureki O, Hori H, Journal of Biological Chemistry, 287, (51) 42480 - 42494,   2012年12月
  • X-ray structure of the fourth type of archaeal tRNA splicing endonuclease: insights into the evolution of a novel three-unit composition and a unique loop involved in broad substrate specificity.
    Hirata A, Fujishima K, Yamagami R, Kawamura T, Banfield JF, Kanai A, Hori H, Nucleic Acids Research, 40, (20) 10554 - 10566,   2012年11月
  • The 2'-O-methylation status of a single guanosine controls transfer RNA-mediated Toll-like receptor 7 activation or inhibition.
    Jöckel S, Nees G, Sommer R, Zhao Y, Cherkasov D, Hori H, Ehm G, Schnare M, Nain M, Kaufmann A, Bauer S, Journal of Experimental Medicine, 209, (2) 235 - 241,   2012年02月
  • Cleavage of intron from the standard or non-standard position of the precursor tRNA by the splicing endonuclease of Aeropyrum pernix, a hyper-thermophilic Crenarchaeon, involves a novel RNA recognition site in the Crenarchaea specific loop.
    Hirata A, Kitajima T, Hori H, Nucleic acids research, 39, (21) 9376 - 9389,   2011年11月
  • Substrate tRNA recognition mechanism of a multisite-specific tRNA methyltransferase, Aquifex aeolicus Trm1, based on the X-ray crystal structure.
    Awai T, Ochi A, Ihsanawati, Sengoku T, Hirata A, Bessho Y, Yokoyama S, Hori H, Journal of Biological Chemistry, 286, (40) 35236 - 35246,   2011年10月
  • Pseudouridine at position 55 (Y55) in tRNA controls the contents of other modified nucleotides for low-temperature adaptation in the extreme-thermophilic eubacterium Thermus thermophilus.
    K. Ishida, T. Kunibayashi, C. Tomikawa, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori, Nucleic Acids Research, 39, (6) 2304 - 2318,   2011年03月
  • Flexible recognition of the tRNA G18 methylation target site by TrmH methyltransferase through first binding and induced fit processes
    OCHI Anna, MAKABE Koki, KUWAJIMA Kunihiro, HORI Hiroyuki, Journal of Biological Chemistry, 285, (12) 9018 - 9029,   2010年03月
  • N7-Methylguanine at position 46 (m7G46) in tRNA from Thermus thermophilus is required for cell viability through a tRNA modification network
    TOMIKAWA Chie, YOKOGAWA Takashi, KANAI Tamotsu, and HORI Hiroyuki, Nucleic Acids Reseach, 38, (3) 942 - 957,   2010年01月
  • Aquifex aeolicus tRNA (N2, N2-guanine)-dimethyltransferase (Trm1) catalyzes transfer of methyl groups not only to guanine 26 but also to guanine 27 in tRNA.
    AWAI Takako, KIMURA Satoshi, TOMIKAWA Chie, OCHI Anna, IHSANAWATI, BESSHO Yoshitaka, YOKOYAMA Shigeyuki, OHNO Satoshi, NISHIKAWA Kazuya, YOKOGAWA Takashi, SUZUKI Tsutomu, and HORI Hiroyuki, Journal of Biological Chemistry, 284, (31) 20467 - 20478,   2009年07月
  • Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase
    NISHIMASU Hiroshi, ISHITANI Ryuichiro, YAMASHITA Koki, IWASHITA Chikako, HIRATA Akira, HORI Hiroyuki, and NUREKI Osamu, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, (20) 8180 - 8185,   2009年05月
  • Stabilization of tRNA (m1G37) methyltransferase [TrmD] from Aquifex aeolicus by an intersubunit disulfide bond formation.
    TOYOOKA Takashi, AWAI Takako, KANAI Tamotsu, IMANAKA Tadayuki, HORI Hiroyuki, Genes to Cells, 13, (8) 807 - 816,   2008年08月
  • The C-terminal region of thermophilic tRNA (m7G46) methyltransferase (TrmB) stabilizes the dimer structure and enhances fidelity of methylation
    C. Tomikawa, A. Ochi, and H. Hori, Proteins: Structure, Function and Bioinformatics, 71, (3) 1400 - 1408,   2008年05月
  • Production of Yeast tRNA (m7G46) Methyltransferase (Trm8-Trm82 Complex) in a Wheat Germ Cell-Free Translation System
    MATSUMOTO Keisuke, TOMIKAWA Chie, TOYOOKA Takashi, OCHI Anna, TAKANO Yoshitaka, TAKAYANAGI Naoyuki, ABE Masato, ENDO Yaeta, and HORI Hiroyuki, Journal of Biotechnology, 133, (4) 453 - 460,   2008年02月
  • Dimer-oligomer interconversion of wild-type and mutant rat 2-Cys peroxiredoxin: disulfide formation at dimer-dimer interface is not essential for decamerization.
    MATSUMURA Tomohiro, OKAMOTO Ken, IWAHARA Shin‐ichiro, HORI Hiroyuki, TAKAHASHI Yuriko, NISHINO Takeshi, ABE Yasuko, Journal of Biological Chemistry, 283, (1) 284 - 293,   2008年01月
  • Detection of structural changes in a cofactor binding protein by using a wheat germ cell-free protein synthesis system coupled with unnatural amino acid probing
    M. Abe, S. Ohno, T. Yokogawa, T. Nakanishi, F. Arisaka, T. Hosoya, T. Hiramatsu, M. Suzuki, T. Ogasawara, T. Sawasaki, K. Nishikawa, M. Kitamura, H. Hori, and Y. Endo, Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 67, (3) 643 - 652,   2007年05月
  • RNA recognition mechanism of eukaryote tRNA (m7G46) methyltransferase (Trm8-Trm82 complex)
    K. Matsumoto, T. Toyooka, C. Tomikawa, A. Ochi, Y. Takano, N. Takayanagi, Y. Endo, and H. Hori, FEBS Letters, 581, (8) 1599 - 1604,   2007年04月
  • The substrate specificity of tRNA (m1G37) methyltransferase (TrmD) from Aquifex aeolicus
    TAKEDA Hiroshi, TOYOOKA Takashi, IKEUCHI Yoshiho, YOKOBORI Shin‐ichi, OKADOME Kan, TAKANO Fuyumi, OSHIMA Tairo, SUZUKI Tsutomu, ENDO Yaeta, HORI Hiroyuki, Genes to Cells, 11, (12) 1353 - 1365,   2006年12月
  • Functional categorization of the conserved basic amino acid residues in TrmH [tRNA (Gm18) methyltansferase] enzymes
    WATANABE Kazunori, NUREKI Osamu, FUKAI Shuya, ENDO Yaeta, HORI Hiroyuki, Journal of Biological Chemistry, 281, (45) 34630 - 34639,   2006年11月
  • A gene involved in modifying transfer RNA is required for fungal pathogenicity and stress tolerance of Colletotrichum lagenarium
    TAKANO Yoshitaka, TAKAYANAGI Naoyuki, HORI Hiroyuki, IKEUCHI Yoshiho, SUZUKI Tsutomu, KIMURA Akiko, OKUNO Tetsuro, Molecular Microbiology, 60, (1) 81 - 92,   2006年04月
  • Mechanism of conversion of xanthine dehydrogenase to xanthine oxidase: indentification of the two cysteine disulfide bonds and crystal structure of a non-convertible rat liver xanthine dehydrogenase mutant
    NISHINO Tomoko, OKAMOTO Ken, KAWAGUCHI Yuko, HORI Hiroyuki, MATSUMURA Tomohiro, EGER Bryan T., PAI Emil F., NISHINO Takeshi, Journal of Biological Chemistry, 280, (26) 24888 - 24894,   2005年07月
  • Roles of conserved amino acid sequence motifs in the SpoU (TrmH) RNA methyltransferase family
    WATANABE Kazunori, NUREKI Osamu, FUKAI Shuya, ISHII Ryohei, OKAMOTO Hironori, YOKOYAMA Shigeyuki, ENDO Yaeta, HORI Hiroyuki, Journal of Biological Chemistry, 280, (11) 10368 - 10377,   2005年03月
  • Substrate tRNA recognition mechanism of tRNA (m7G46) methyltransferase from Aquifex aeolicus.
    Okamoto H, Watanabe K, Ikeuchi Y, Suzuki T, Endo Y, Hori H, Journal of Biological Chemistry, 279, (47) 49151 - 49159,   2004年11月
  • Deep knot structure for construction of active site and cofactor binding site of tRNA modification enzyme.
    Nureki O, Watanabe K, Fukai S, Ishii R, Endo Y, Hori H, Yokoyama S, Structure (London, England : 1993), 12, (4) 593 - 602,   2004年04月
  • RALyase; a terminator of elongation function of depurinated ribosomes
    OZAWA A, SAWASAKI T, TAKAI K, UCHIUMI T, HORI H, ENDO Y, FEBS Letters, 555, (3) 455 - 458,   2003年12月
  • Aquifex aeolicus tRNA (Gm18) methyltransferase has unique substrate specificity: tRNA recognition mechanism of the enzyme
    HORI H, KUBOTA S, WATANABE K, KIM J‐M, OGASAWARA T, SAWASAKI T, ENDO Y, Journal of Biological Chemistry, 278, (27) 25081 - 25090,   2003年07月
  • Identification and Characterization of tRNA-(Gm18)-methyltransferase from Thermus thermophilus HB8; Domain Structure and Conserved Amino Acid Sequence Motifs
    HORI H, SUZUKI T, SUGAWARA K, INOUE Y, SHIBATA T, KURAMITSU S, YOKOYAMA S, OSHIMA T, WATANABE K, Genes to Cells, 7, (3) 259 - 272,   2002年03月
  • Selective Inhibition of Human Inducible Nitric Oxide Synthase by S-Alkyl-L-Isothiocitrulline-Containing Dipeptide
    PARK J‐M, HIGUCHI T, KIKUCHI K, URANO Y, HORI H, NISHINO T, AOKI J, INOUE K, NAGANO T, British Journal of Pharmachology, 132, (8) 1876 - 1882,   2001年04月
  • X-Ray Absorption Spectroscopic Analysis of the High-Spin Ferriheme Site in Substrate-Bound Neuronal Nitric-Oxide Synthase
    N. J. Cosper, R. A. Scott, H. Hori, T. Nishino, and T. Iwasaki, Journal of Biochemistry, 130, 191 - 198,   2001年
  • Sequence Motif-Specific Assignment of Two [2Fe-2S] Clusters in Rat Xanthine Oxidoreductase Studied by Site-Directed Mutagenesis
    Iwasaki T, Okamoto K, Nishino T, Mizushima J, Hori H., Journal of Biochemistry, 127, 771 - 778,   2000年
  • Binding Analysis of Xenopus Laevis Translation Initiation Factor 4E(eIF4E)in Initiation Complex Formation
    Miyoshi H, Youtani T, Ide H, Hori H, Okamoto K, Ishikawa M, Wakiyama M, Nishino T, Ishida T, Miura K., Journal of Biochemistry, 126, 897 - 904,   1999年
  • Inhibition of Neuronal Nitric Oxide Synthase by Phosphatidilinositol 4,5-Bisphosphate and Phosphatidic Acid
    H. Hori, T. Iwasaki, Y. Hayashi, Y. Kurahashi, T. Matsumura, and T. Nishino, Journal of Biochemistry, 126, 829 - 837,   1999年
  • Crystallographic Characterization of a Stress-Induced Multifunctional Protein, Rat HBP23
    HIROTSU S, ABE Y, NAGAHARA N, HORI H, NISHINO T, OKADA K, HAKOSHIMA T, Journal of Structure Biology, 126, (1) 80 - 83,   1999年
  • Characterization of nNOS2, a Natural Valiant of Neuronal Nitric Oxide Synthase Constitutively Produced in Mouse Brain by Selective Alternative Splicing
    IWASAKI T, HORI H, HAYASHI Y, NISHINO T, TAMURA K, OUE S, IIZUKA T, OGURA T, ESUMI H, Journal of Biological Chemistry, 274, (25) 17559 - 17566,   1999年
  • Crystal Structure of a Multifunctional 2-Cys Peroxiredoxin, HBP23/PAG
    HIROTSU S, ABE Y, OKADA K, NAGAHARA N, HORI H, NISHINO T, HAKOSHIMA T, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 96, (22) 12333 - 12338,   1999年
  • Modulation of the Remote Heme Site Geometry of Recombinant Mouse Neuronal Nitric Oxide Synthase by the N-Terminal Hook Region
    IWASAKI T, HORI H, HAYASHI Y, NISHINO T, Journal of Biological Chemistry, 274, (12) 7705 - 7713,   1999年
  • Comparison of Nitric Oxide Synthase in Normal Human Placenta from 37 to 41 weeks Gestation
    J. Matern. Fetal Invest., 8, 138 - 141,   1998年
  • Substrate Recognition of tRNA(Guanosine-2'-)-Methyltransferase from Thermus thermophilus HB27
    HORI H, YAMAZAKI N, MATSUMOTO T, WATANABE Y, UEDA T, NISHIKAWA K, KUMAGAI I, WATANABE K, Journal of Biological Chemistry, 273, (40) 25721 - 25727,   1998年
  • Conversion of Xanthine Dehydrogenase to Oxidase and Role of Reperfusion Injury
    Biochem. Soc. Trans., 25, 783 - 786,   1997年
  • Evidence for the Existence of Stabilization/Activation Factor : Calcium Dependent Inactivation of Neuronal Nitric Oxide Synthase
    Bichem. Biophys. Res. Commun., 234, 476 - 480,   1997年
  • Substrate Supecificity of tRNA(Adenine-1-)-Methyltransferase from Thermus thermophilus HB27
    Norihiko Yamazaki, Hiroyuki Hori, Kiyoshi Ozawa, Shigeko Nakanishi, Takuya Ueda, Izumi Kumagai, Kimitsuna Watanabe, Kazuya Nishikawa, Biosci. Biotech. Biochem., 58, (6) 1128 - 1133,   1994年
  • AUGU Sequence in the Anticodon Loop is a Minimum Requirment for Recognition by Escherichia coli tRNA-Guanine Transglycosylase.
    J. Biol. Chem., 269, 32221 - 32225,   1994年
  • Recognition Sites of tRNA by a Thermostable tRNA(Guanosine-2'-)-Methyltransferase from Thermus thermophilus HB 27
    J. Biochem., 107, 331 - 338,   1990年
  • Effects of Modification of 4-Thiouridine in E. coli tRNAMetf on its Methyl Acceptor Activity by Thermostable Gm-methylases
    J. Biochem., 106, 798 - 802,   1989年
  • Synthesis of Nonadeca- and Octadecaribonucleotides Using the Solid-Phase Phosphotriester with Tetrahydropyranyl Groups as the 2'-Hydroxyl-Protecting Group
    HIRAO I, ISHIKAWA M, HORI H, WATANABE K, MIURA K, Bull. Chem. Soc. Jpn., 62, (6) 1995 - 2001,   1989年

MISC

  • Enzymatic and Crystallographic Characterization of Archaeal tRNA Splicing Endonuclease
    Tsubasa Kitajima, Akira Hirata, Chicako Iwashita, Shin-ichi Yokobori, and Hiroyuki Hori, IEEE: Micro-NanoMechatronics and Human Science, P2,   2009年
  • Broad substrate RNA specificity of Trm1 [tRNA (m22G26) methyltransferase] from Aquifex aeolicus
    Takako Awai, and Hiroyuki Hori, IEEE: Micro-NanoMechatronics and Human Science, CFP08768,   2008年
  • Complex Formations between Artificial RNA-DNA Chimera Nucleic Acids and RNA Modification Enzymes
    Anna Ochi and Hiroyuki Hori, IEEE: Micro-NanoMechatronics and Human Science,   2007年
  • Differences in substrate selectivity of the new SPOUT superfamily of methyltransferases
    Takashi Toyooka, and Hiroyuki Hori, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 51,   2007年
  • Hydroxyl Radical Probing of tRNA (Gm18) methyltransferase [TrmH] -AdoMet-artificial tRNA ternary complex
    Anna Ochi, and Hiroyuki Hori, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 51,   2007年
  • Hetero subunit interaction and RNA recognition of yeast tRNA (m7G46) methyltransferase synthesized in a wheat germ cell-free translation system
    Yuki Muneyoshi, Keisuke Matsumoto, Chie Tomikawa, Takashi Toyooka, Anna Ochi, Takashi Masaoka, Yaeta Endo, Hiroyuki Hori, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 51,   2007年
  • Hetero subunits assembly study of RNA modification enzyme by wheat germ cell-free translation system
    K. Matsumoto, M. Abe, Y. Takano, N. Takayanagi, Y. Endo, and H. Hori, IEEE: Micro-NanoMechatronics and Human Science,   2006年
  • Amount changes of tRNA modification enzymes in Thermus thermophilus HB8 cells according to culture temperatures
    C. Iwashita, and H. Hori, Nucleic Acids Res. Symp., 50,   2006年
  • The core domain of Aquifex aeolicus tRNA (m7G46) methyltransferase has the methyl-transfer activity to tRNA
    C. Tomikawa, and H. Hori,, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 50,   2006年
  • Molecular evolution of transfer RNA methyltransferase
    Hiroyuki Hori, Annual Journal of Engineering Ehime University, 4,   2005年
  • A novel tRNA recognition mechanism of Aquifex aeolicus Trm1 [tRNA (m22G26) methyltransferase]
    T. Awai, T. Takehara, H. Takeda, and H. Hori, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 49,   2005年
  • Structural change of tRNA (Gm18) methyltransferase by binding of methyl donor analogues
    K. Watanabe, O. Nureki, S. Fukai, Y. Endo, and H. Hori, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 49,   2005年
  • Application of cell-free translation systems to studies of cofactor binding proteins
    M. Abe, H. Hori, T. Nakanishi, F. Arisaka, T. Ogasawara, T. Sawasaki, M. Kitamura, and Y. Endo, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 48,   2004年
  • Identification of Aquifex aeolicus tRNA (m22G26) Methyltransferase Gene
    H. Takeda, H. Hori, and Y. Endo, Nucleic Acids Res. Supplement, 2,   2002年
  • Identification of Essential Amino Acid Residues of tRNA (Gm18) Methyltransferase for Methyl-Transfer Activity
    K. Watanabe, H. Hori, and Y. Endo, Nucleic Acids Res. Supplement, 1,   2001年
  • Identification of Thermus thermophilus HB8 tRNA (Gm18) Methyltransferase Gene.
    H. Hori, T. Suzuki, K. Sugawara, Y. Inoue, T. Shibata, S. Kuramitsu, S. Yokoyama, T. Oshima, and K. Watanabe, Nucleic Acids Res. Symp., 44,   2000年
  • Inducible Nitric Oxide Synthase in Human Plancenta
    Y. Otsubo, H. Hori, R. Sawa, T. Yoneyama, T. Nishino, and T. Araki, Placenta, 19,   1998年
  • Heme-Binding Domain and the Threonine Mutants of Mouse Neuronal Nitric Oxide Synthase.
    T. Iwasaki, H. Hori, Y. Hayashi, and T. Nishino, J. Inorganic Biochemistry, 67,   1997年
  • Activity and Isoform of Nitric Oxide Synthase Families in Human Placenta.
    Y. Otsubo, H. Hori, R. Sawa, S. Susumi, T. Nishino, and T. Araki, J. Jpn. Soc. Womens Nutr. Metab., 3,   1997年
  • Effect of Phospholipids on Calcium-Dependent Inactivation of Neuronal Nitric Oxide Synthase.
    H. Hori, T. Iwasaki, T. Kurahashi, Y. Hayashi, M. Umeda, and T. Nishino, Jpn. J. Phamacol., 75,   1997年
  • Expression of Xenopus laevis Translation Initiation Factor 4E (eIF-4E) by Baculovirus-Insect Cell System
    H. Miyoshi, K. Ito, N. Sakai, J. Mizushima, K. Okamoto, H. Hori, T. Nishino, M. Wakiyama and K.-I. Miura, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 37,   1997年
  • Essentially Minimal Sequnece for Substrate Recognition by tRNA (Guanosine-2'-)-Methyltransferase from Thermus thermophilus HB27
    H. Hori, N. Yamazaki, T. Matsumoto, T. Ueda, K. Nishikawa, I. Kumagai, K. Watanabe, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 37,   1997年
  • Purification and Characterization of tRNA (Adenine-1-)-Methyltransferase from Thermus thermophilus HB27
    N. Yamazaki, H. Hori, K. Ozawa, S. Nakanishi, T. Ueda, I. Kumagai, K. Watanabe, and K. Nishikawa, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 27,   1992年
  • Effects of Modification of 4-Thiouridine in E. coli tRNAMetf on Methylation Reaction with a Thermostable Gm-methylase
    H. Hori, K. Watanabe, M. Saneyoshi, I. Kumagai, I. Hirao, and K. Miura, Nucleic Acids Res. Symp. Ser., 17,   1986年
  • Two Types of tRNA(Gm)methylase Found in Extreme Thermophile, Thermus thermophilus strains HB 8 and HB 27
    H. Hori, T. Matsumoto, K. Watanabe, and K. Miura, Nucleic Acids Res. Symp.Ser., 16,   1985年

書籍等出版物

講演・口頭発表等

  • アーキアRNAポリメラーゼの転写活性化型開始複合体の構造解析に向けての準備状況
    小西 智也、金井 保、跡見 晴幸、堀 弘幸、平田 章, 極限環境生物学会年会,   2017年11月11日
  • 芳香族アミノ酸の生合成遺伝子群の発現を制御するアーキア転写活性化因子(Tar)の分子認識機構の解明
    臼井 孝典、金井 保、跡見 晴幸、堀 弘幸、平田 章, 極限環境生物学会年会,   2017年11月11日
  • 乳酸菌に存在する異様なtRNAIle(UAU)の解析
    冨川千恵、Sylvie Auxilien, Vincent Guerineau, 吉岡裕也、三好規代、林 実、堀 弘幸、Dominique Fourmy、高井和幸、吉澤聡子, 第19回日本RNA学会年会,   2017年07月19日
  • 大腸菌tRNA(Gm18)メチル化酵素(TrmH)のX線結晶構造とその基質tRNA選択システム
    伊藤亜沙子、山上龍太、河野 陽、平田 章、堀 弘幸, 第19回日本RNA学会年会,   2017年07月19日
  • 好熱好酸性古細菌Thermoplasma acidophilum Trm56の分析
    長谷川貴洋、福本修平、河村卓哉、堀 弘幸, 第19回日本RNA学会年会,   2017年07月19日
  • 好熱好酸性古細菌Thermoplasma acidophilumのアーケオシン tRNA グアニントランスグリコシラーゼは、tRNAの13位、15位のグアニンに作用するマルチサイト特異性酵素である
    河村卓哉、平田 章、大野 敏、能村友一朗、長野倫子、行木信一、横川隆志、堀 弘幸, 第19回日本RNA学会年会,   2017年07月19日
  • RNAメチル化酵素とその修飾ヌクレオシドの多様性
    堀 弘幸, 大阪市立大学大学院工学研究科化学生物系専攻セミナー,   2017年06月15日, 招待有り
  • RNAメチル化酵素とメチル化ヌクレオシドの構造と機能の多様性
    堀 弘幸, 東京大学新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻大学院講演会,   2017年05月26日, 招待有り
  • 高度好熱菌Thermus thermophilusの長鎖・分岐鎖ポリアミンは主に高温環境下でのリボソームの維持に必要である
    Misa Nakashima, Ryota Yamagami, Yuki Ochi, Chie Tomikawa, Toshiyuki Moriya, Dominique Fourmy, Satoko Yoshizawa, Tairo Oshima, and Hiroyuki Hori, 第39回日本分子生物学会年会,   2016年12月02日
  • tRNA(Gm18)メチル化酵素(TrmH)のX線結晶構造とその基質tRNA認識機構
    伊藤亜沙子、山上龍太、平田 章、堀 弘幸, 第39回日本分子生物学会年会,   2016年11月30日
  • 超好熱性アーキアMethanopyrus kandleri由来tRNA スプライシングエンドヌクレアーゼの基質認識に関する研究
    金田綾乃、森数 渉、堀 弘幸、平田 章, 極限環境生物学会2016年度(第17回)年会,   2016年11月25日
  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis KOD1由来RNA m5C修飾酵素の構造機能解析
    山内 綾乃、平田 章、前田 雄太、堀 弘幸, 極限環境生物学会2016年度(第17回)年会,   2016年11月25日
  • Structural and functional analyses reveal mechanistic insight into a site specificity of the archaeal tRNA m2G/m22G10 methyltransferase (aTrm11)
    Akira Hirata, Seiji Nishiyama, Toshihiro Tamura, Ayano Yamauchi and Hiroyuki Hori, Extremophiles 2016,   2016年09月12日
  • The long and branched polyamines of Thermus thermophilus, an extremely thermophilic eubacterium, are required for maintenance of ribosome at high temperatures
    Misa Nakashima, Ryota Yamagami, Yuki Ochi, Chie Tomikawa, Toshiyuki Moriya, Dominique Fourmy, Satoko Yoshizawa, Tairo Oshima, and Hiroyuki Hori, Extremophiles 2016,   2016年09月12日
  • Multisite-specific archaeosine tRNA-guanine transglycosylase (ArcTGT) from Thermoplasma acidophilum, a thermo-acidophilic archaeon
    Takuya Kawamura, Akira Hirata, Satoshi Ohno, Yuichiro Nomura, Tomoko Nagano, Nobukazu Nameki, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori, tRNA 26th Conference,   2016年09月04日
  • Characterization of tRNAIle(UAU) in lactobacilli
    Chie Tomikawa, Sylvie Auxilien, Vincent Guérineau, Yuya Yoshioka, Kiyo Miyoshi, Minoru Hayashi, Hiroyuki Hori, Dominique Fourmy, Kazuyuki Takai, and Satoko Yoshizawa, tRNA 26th Conference,   2016年09月04日
  • Thermoplasma acidophilum 細胞抽出液中には、tRNAの4-チオウリジン合成に関わる新たな因子が存在する
    上田隼也、松本奈津実、河村卓哉、堀 弘幸, 第29回日本Archaea研究会,   2016年07月07日
  • アーキアtRNA (m2G10/m22G10) メチル基転移酵素arcTrm11の基質認識機構に関する研究
    平田 章、西山 聖示、田村 俊浩、山内 綾乃、堀 弘幸, 第29回日本Archaea研究会,   2016年07月07日
  • Structural and founctional analyses reveal mechanistic insight into a site specificity of the archaeal tRNA methyltransferase
    Akira Hirata, Seiji Nishiyama, Toshihiro Tamura, Ayano Yamauchi and Hiroyuki Hori, RNA 2016,   2016年06月28日
  • Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI)
    Hiroyuki Takuma, Natsumi Ushio, Masayuki Minoji, Ai Kazayama, Naoki Shigi, Akira Hirata, Chie Tomikawa, Anna Ochi, and Hiroyuki Hori, RNA 2016,   2016年06月28日
  • Functional analysis of tRNAIle(UAU) in Lactic acid bacteria
    Chie Tomikawa, Sylvie Auxilien, Vincent Guérineau, Yuya Yoshioka, Kiyo Miyoshi, Minoru Hayashi, Hiroyuki Hori, Dominique Fourmy, Kazuyuki Takai, and Satoko Yoshizawa, RNA 2016,   2016年06月28日
  • RNA科学の拠点形成 その3年間
    堀 弘幸, 第11回愛媛大学学術フォーラム,   2016年03月18日, 招待有り
  • 真核微生物由来tRNA(Gm34)メチル化酵素Trm7-Trm734の構造機能解析
    岡田圭祐、吉井一晃、平田 章、堀 弘幸, 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会(BMB2015),   2015年12月01日
  • アーキアtRNA(m2G10/m22G10)メチル化酵素arcTrm11のX線結晶構造 –tRNA修飾酵素の部位特異性を決定している共通原理の統一的理解-
    平田 章、西山聖示、田村俊浩、山内綾乃、堀 弘幸, 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会(BMB2015),   2015年12月01日
  • tRNAと長鎖非コードRNAのメチル化とメチル化酵素を比較する
    堀 弘幸, 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会(BMB2015),   2015年12月01日, 招待有り
  • 乳酸菌におけるAUAコドン翻訳のゆらぎ
    冨川千恵、Sylvie Auxilien, Vincent Guerinaeu, 吉岡裕也、三好規代、堀 弘幸、高井和幸、吉澤聡子, 第38回日本分子生物学会・第88回日本生化学会合同年会(BMB2015),   2015年12月01日
  • アーキアtRNA(m2G10/m22G10)メチル化酵素arcTrm11の基質認識機構の解明
    平田 章、西山 聖示、田村 俊浩、山内 綾乃 堀 弘幸, 極限環境生物学会2015年度(第16回)年会,   2015年11月08日
  • Multisite-specific archaeosine tRNA-guanine transglycosidase from Thermoplasma acidophilum
    Takuya Kawamura, Akira Hirata, Yuichiro Nomura, Nobukazu Nameki, Satoshi Ohno, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori, Thermophiles 2015,   2015年08月30日
  • The folate-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO) relates to the adaptation at low-temperature environment and regulates methyl group metabolism in Thermus thermophilus
    Ryota Yamagami, Chie Tomikawa, Naoki Shigi, Ai Kazayama, Shin-ichi Asai, Hiroyuki Takuma, Akira Hirata, Dominique Fourmy, Haruichi Asahara, Kimitsuna Watanabe, Satoko Yoshizawa, and Hiroyuki Hori, Thermophiles 2015,   2015年08月30日
  • アーキアのtRNA修飾と修飾酵素:真正細菌とも真核生物とも異なる世界
    堀 弘幸, 日本Archaea研究会第28回講演会シンポジウム,   2015年07月23日, 招待有り
  • アーキアにおける3’-5’RNAリガーゼの機能解析
    藤井乃志朗、山本泰治、堀 弘幸、平田 章, 日本Archaea研究会第28回講演会,   2015年07月23日
  • 新たなtRNA37位N1-メチルグアノシン合成経路がアーキアには存在する
    長谷川貴洋、河村卓哉、堀 弘幸, 日本Archaea研究会第28回講演会,   2015年07月23日
  • Thermoplasma acidophilumにおけるアーケオシンtRNAクアニントランスグリコシラーゼのマルチサイト特異性の解析
    河村卓哉、平田 章、能村友一朗、行木信一、大野 敏、横川 隆志、堀 弘幸, 日本Archaea研究会第28回講演会,   2015年07月23日
  • 乳酸菌ディコーディングシステムにおける四次元直交性のゆらぎ
    冨川 千恵、Sylvie Auxilien、Vincent Guérineau、吉岡 裕也、三好 規代、堀 弘幸、高井 和幸、吉澤 聡子, 第17回日本RNA学会年会,   2015年07月15日
  • 高度好熱菌Thermus thermophilesポリアミン合成系は転写・翻訳系に作用するか
    中嶋 美沙, 越智 裕貴, 山上 龍太, 大島 泰郎, 堀 弘幸, 第17回日本RNA学会年会,   2015年07月15日
  • Yeast tRNA (m2G10) methytransferase (Trm11-Trm112) has a strict substrate recognition mechanism.
    Shiho Ohmori, Yu Nishida, Kazuki Okada, Akira Hirata, and Hiroyuki Hori, 第37回日本分子生物学会年会,   2014年11月25日
  • Are modified nucleosides in tRNA responsible for D20 formation of Thermus thermophilus?
    H. Kusuba, T. Yoshida, E. Iwasaki, T. Awai, A. Hirata, C. Tomikawa, A, Kazayama, R. Yamagami, and H. Hori, 第37回日本分子生物学会年会,   2014年11月25日
  • 好熱好酸性古細菌Thermoplasma acidophilum tRNALeu アンチコドンに存在する修飾ヌクレオシド生合成経路の探索
    東口実結、河村卓哉、安楽 遼、坂口裕理子、鈴木 勉、堀 弘幸, 第15回極限環境生物学会,   2014年11月01日
  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来多機能性転写因子(Tgr) のX線結晶構造解析
    杉野洋誉、金井 保、跡見晴幸、堀 弘幸、平田 章, 第15回極限環境生物学会,   2014年11月01日
  • 超好熱性アーキアMethanopyrus kandleri由来tRNA スプライシングエンドヌクレアーゼの構造機能解析
    金田綾乃、森数 渉、堀 弘幸、平田 章, 第15回極限環境生物学会,   2014年11月01日
  • 高度好熱菌Thermus thermophilusにおけるtRNA修飾ネットワーク上から見た葉酸依存性RNAメチル化酵素TrmFOの存在意義
    山上龍太、鴫 直樹、朝井真一、渡辺公綱、堀 弘幸, 第15回極限環境生物学会,   2014年11月01日
  • アーキアの互換性機能を用いたThermoplasma acidophilumア―ケオシンtRNA-グアニントランスグリコシラーゼ反応機構の解明
    河村卓哉, 平田 章, 能村友一朗, 行木信一, 岡 夏央, 谷口浩輝, 安藤香織, 大野 敏, 横川隆志, 堀 弘幸, 第15回極限環境生物学会,   2014年11月01日
  • 固相化DNAプローブ法を用いた好熱菌tRNAの大量精製法の確立と新しいDNA固定化法の開発
    風山 愛、山上龍太、横川隆志、堀 弘幸, 第15回極限環境生物学会,   2014年11月01日
  • 真正細菌Thermus thermophilusのD20形成における、tRNA上の他の修飾ヌクレオチドの関わりは?
    楠葉浩晃, 吉田剛士, 岩崎絵梨, 粟井貴子, 平田 章, 冨川千恵, 風山 愛, 山上龍太, 堀 弘幸, 第4回モデル生物丸ごと一匹学会・第13回丸ごと一匹プロジェクト連携研究会,   2014年09月27日
  • Alteration of solid-phase DNA probe method for large-scale tRNA purification
    Ai Kazayama, Ryota Yamagami, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori, 25th tRNA conference,   2014年09月21日
  • Topological knot tRNA methyltransferase (TrmH) discriminates substrate tRNA from non-substrate tRNA by a multistep recognition mechanism.
    Anna Ochi, Koki Makabe, Ryota Yamagami, Akira Hirata, Reiko Sakaguchi, Ya-Ming Hou, Kazunori Watanabe, Osamu Nureki, Kunihiro Kuwajima, and Hiroyuki Hori, 25th tRNA conference,   2014年09月21日
  • How does the folate dependent tRNA (m5U54) methyltransferase (TrmFO) recognize substrate tRNA?
    R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Tomikawa, A. Ochi, C. Iwashita, R. Ishitani, O. Nureki, and H. Hori, 25th tRNA conference,   2014年09月21日
  • Unprecedented archaeal tRNA modifications found in Thermoplasma acidophilum
    C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, T. Kawamura, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori, 25th tRNA conference,   2014年09月21日
  • The possibility for presence of circular tRNA in Lactobacillus plantarum
    C. Tomikawa, S. Auxilien, H. Hori, K. Takai, and S. Yoshizawa, 第16回日本RNA学会年会,   2014年07月24日
  • トポロジカルノット型tRNAメチル化酵素(TrmH)の触媒ドメインによる基質tRNAと基質にならないtRNAの識別
    越智杏奈、真壁幸樹、山上龍太、平田 章、坂口怜子、Ya-Ming Hou、渡辺和則、濡木 理、桑島邦博、堀 弘幸, 第16回日本RNA学会,   2014年07月23日
  • 固相化DNAプローブ法を用いたtRNAの大量精製法の確立
    風山 愛、山上龍太、横川隆志、堀 弘幸, 第16回日本RNA学会,   2014年07月23日
  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis tRNA (m2G10/m22G10)メチル基転移酵素の構造・生化学・遺伝学的解析
    平田 章、西山聖示、田村俊浩、堀 弘幸, 第16回日本RNA学会,   2014年07月23日
  • 葉酸依存性RNAメチル化酵素TrmFOの遺伝学的解析
    山上龍太、鴫 直樹、朝井信一、渡辺公綱、堀 弘幸, 第16回日本RNA学会,   2014年07月23日
  • サーマス・サーモフィラス由来tRNA メチル化酵素TrmFOの基質認識機構
    山上龍太,山下光輝,西増 弘志,冨川 千恵,越智 杏奈,岩下 智香子,平田 章,石谷隆一郎,濡木 理,堀  弘幸, 第14回日本RNA学会年会,   2014年07月16日
  • tRNAと長鎖非コードRNAのメチル化とメチル化酵素を比較する
    堀 弘幸, 第3回長鎖非コードRNA研究会,   2014年07月09日, 招待有り
  • 超好熱性アーキアThermococcuskodakarensis由来tRNA(m2G10/m22G10)メチル基転移酵素のX線結晶構造
    平田 章、西山聖示、田村俊浩、堀 弘幸, 第14回日本蛋白質科学会,   2014年06月25日
  • 平成25年度 研究活性化事業・拠点形成:RNA科学の拠点形成
    堀 弘幸, 第7回愛媛大学学術フォーラム,   2014年01月10日, 招待有り
  • Prediction of genes for tRNA modifications in the thermoacidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum
    Ryo Anraku, Miyu Higashiguchi, Takuya Kawamura, and Hiroyuki Hori, 第36回日本分子生物学会年会,   2013年12月03日
  • Alteration of solid-phase DNA probe method for large-scale tRNA purification
    Ai Kazayama, Ryota Yamagami, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori, 第36回日本分子生物学会年会,   2013年12月03日
  • Novel tRNA modifications in the thermophilic-acidophilic archaeon, Thermoplasma acidophilum
    )Chie Tomikawa, Takayuki Ohira, Yasushi Inoue, Takuya Kawamura, Akihiko Yamagishi, Tsutomu Suzuki, and Hiroyuki Hori, 第36回日本分子生物学会年会,   2013年12月03日
  • 極限環境生物の棲む世界:極限環境生物のtRNA修飾システム
    堀 弘幸, 岐阜大学工学部セミナー,   2013年11月08日, 招待有り
  • 超好熱性アーキア Thermococcus kodakarensis 由来 tRNATrp の
    前田雄太、平田 章、長野倫子、土手智裕、鈴木健夫、金井 保、鈴木 勉、堀 弘幸, 2013年度極限環境生物学会年会,   2013年10月27日
  • Thermococcus kodakarensis 由来tRNA メチル化酵素(Trm- m22G10)の構造機能解析
    )西山聖示、平田 章、田村俊浩、堀 弘幸, 2013年度極限環境生物学会年会,   2013年10月27日
  • Does D20 formation by eubacterial dihydrouridine synthase require the other modified nucleotides for its modification in tRNA?
    楠葉浩晃、吉田剛士、岩崎絵梨、粟井貴子、平田 章、冨川千恵、山上龍太、堀 弘幸, 、第3回モデル生物丸ごと一匹学会年会,   2013年09月21日
  • Eukaryotic tRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112) recognizes the whole structure of tRNA
    Shiho Ohmori, Yu Nishida, Kazuki Okada, Akira Hirata, and Hiroyuki Hori, 第3回モデル生物丸ごと一匹学会年会,   2013年09月21日
  • 固相化DNAプローブ法を用いた好熱菌tRNAの大量精製法の確立
    Ai Kazayama, Ryota Yamagami, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori, 第3回モデル生物丸ごと一匹学会年会,   2013年09月20日
  • 極限環境生物の棲む世界・イエローストーン国立公園、好熱菌のtRNA修飾ネットワークを活かした環境適応
    堀 弘幸, 弘前大学農学生命科学部第9回研究推進セミナー・その2,   2013年09月20日, 招待有り
  • tRNAメチル化酵素の構造と機能:その多様性と分子進化
    堀 弘幸, 弘前大学農学生命科学部第9回研究推進セミナー・その1,   2013年09月20日, 招待有り
  • X-ray crystal structure of the fourth type of tRNA splicing endonuclease from an uncultivated archaeon Candidatus Micrarchaeum acidiphilum (ARMAN-2)
    Akira Hirata, Kosuke Fujishima, Ryota Yamagami, Takuya Kawamura, Jillian F. Banfiled, Akio Kanai and Hiroyuki Hori, Thermophiles 2013,   2013年09月08日
  • The synthesis mechanism of a tRNA modification in thermophilic bacteria
    Takuya Kawamura, Chie Tomikawa, Takayuki Ohira, Yasushi Inoue, Nobukazu Nameki, Natsuhisa Oka, Hiroki Taniguchi, Kaori Ando, Satoshi Ohno, Akihiko Yamagishi, Tsutom Suzuki, Takashi Yokogawa, and Hiroyuki Hori, Riboclub 2013 Annual Meeting, Canada,   2013年08月22日
  • 葉酸依存性tRNA(m5U54)メチル化酵素TrmFOはどうやってtRNA中のU54を認識しているのか?
    山上龍太, 山下光輝, 西増弘志, 冨川千恵, 越智杏奈, 岩下智香子, 平田 章, 石谷隆一郎, 濡木 理, 堀 弘幸, 第15回日本RNA学会年会,   2013年07月24日
  • 熱ストレスによる開始tRNAMetの細胞内動態
    )渡邉和則、宮川 隆、冨川千恵、水野利恵、高橋昭久、大槻高史、堀弘幸、井尻憲一, 第15回日本RNA学会年会,   2013年07月24日
  • 真正細菌ジヒドロウリジン合成酵素はD20形成にtRNA上の他の修飾ヌクレオチドを必要とする
    楠葉浩晃、吉田剛士、岩崎絵梨、粟井貴子、平田 章、冨川千恵、, 第15回日本RNA学会年会,   2013年07月24日
  • Thermoplasma acidophilum由来tRNALeuにおいてArchaeosineが2カ所に形成されるメカニズムの解析
    河村卓哉, 冨川千恵, 大平高之, 井上 仁, 行木信一, 岡 夏央, 谷口浩輝, 安藤香織, 大野 敏,山岸明彦, 鈴木 勉, 横川隆志, 堀 弘幸, 第15回日本RNA学会年会,   2013年07月24日
  • 超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis 2´-5´ RNA リガーゼの機能解析
    平田 章、長野倫子、石丸雄基、金井 保、鈴木健夫、佐藤朝子、金井昭夫、鈴木 勉、堀 弘幸, 、第15回日本RNA学会年会,   2013年07月24日
  • Yeast tRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の基質認識機構の解明
    大森志穂、西田 裕、岡田和樹、平田 章、堀 弘幸, 第15回日本RNA学会年会,   2013年07月24日
  • m7G46およびΨ55を中心としたThermus thermophilus tRNA修飾ネットワーク
    冨川千恵、石田一雄、国林貴史、金井 保、横川隆志、堀 弘幸, 第15回日本RNA学会年会,   2013年07月23日
  • 極小アーキア(古細菌)における4番目のタイプtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼのX線結晶構造
    平田 章、藤島皓介、山上龍太、河村卓哉、Jillina F. Banfield、金井昭夫、堀 弘幸, 第13回蛋白質科学会,   2013年06月12日
  • Negative control of Gm18, m5s2U54 and m1A58 modifications by pseudouridine55 modification in Thermus thermophilus tRNAs: the tRNA modification network in extreme thermophile
    C. Tomikawa, K. Ishida, T. Kunibayashi, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori, 24th tRNA workshop,   2012年12月
  • Improvement of a protein purification method for nucleic acid-free in the case of recombinant tRNA (N2,N2-guanine)-dimethyltransferase (Trm1) from Aquifex aeolicus
    S. Nishiyama, A. Hirata, T. Awai, and H. Hori, 第35回日本分子生物学会年会,   2012年12月
  • Research for substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI)
    H. Takuma, M. Minoji, N. Ushio, C. Tomikawa, A. Hirata, A. Ochi and H. Hori,   2012年12月
  • tRNA modifications in thermoacidophilic archaeon
    T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori, 第35回日本分子生物学会年会,   2012年12月
  • Structural and functional analyses of archaeal 2’-5’ RNA ligase
    T. Nagano, A. Hirata, Y. Ishimaru, T. Kanai, and H. Hori, 第35回日本分子生物学会年会,   2012年12月
  • 酵母由来のtRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の基質認識機構の解明
    西田 裕、岡田和樹、平田 章、堀 弘幸, 第35回日本分子生物学会年会,   2012年12月
  • Expression and purification of yeast tRNA (Cm32/Gm34) methyltransferase (Trm7)
    K. Yoshii, A. Hirata, and H. Hori, 第35回日本分子生物学会年会,   2012年12月
  • RNAメチル化酵素の構造と反応機構の多様性
    堀 弘幸, 岐阜大学生命工学科セミナー,   2012年11月26日, 招待有り
  • RNAメチル化酵素の構造と反応機構の多様性:トポロジカル・ノット型RNAメチル化酵素発見からの8年間
    堀 弘幸, 第184回応用化学科セミナー,   2012年10月30日, 招待有り
  • Visiting Yellowstone National Park, the place of discovery of thermophiles
    堀 弘幸, 第2回モデル生物丸ごと一匹学会,   2012年09月28日
  • Adaptation of Thermus thermophilus to environmental temperature via tRNA modification enzymes-modified nucleotides network in tRNA
    C. Tomikawa, K. Ishida, T. Kunibayashi, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori, 第2回モデル生物丸ごと一匹学会,   2012年09月28日
  • Functional analysis of yeast tRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)
    Y. Nishida, K. Okada, A. Hirata, and H. Hori, 第2回モデル生物丸ごと一匹学会,   2012年09月28日
  • Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI)
    H. Takuma, M. Minoji, N. Ushio, C. Tomikawa, A. Hirata, A. Ochi and H. Hori, 第2回モデル生物丸ごと一匹学会,   2012年09月28日
  • Substrate transfer RNA recognition mechanism of tRNA (m5U54) methyltransferase (TrmFO) based on the biochemical and structural analysis
    R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Iwashita, A. Hirata, O. Nureki, and H. Hori, 第2回モデル生物丸ごと一匹学会,   2012年09月28日
  • Structural insight into the evolution and broad substrate specificity of the fourth type of tRNA splicing endonuclease
    A. Hirata, K. Fujishima, R. Yamagami, T. Kawamura, J. F. Banfiled, A. Kanai, and H. Hori, 9th Extremophiles 2012,   2012年09月09日
  • Transfer RNA recognition mechanism of Thermus thermophilus folate/FAD-dependent tRNA methyltransferase (TrmFO)
    R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Tomikawa, A. Ochi, C. Iwashita, A. Hirata, R. Ishitani, O. Nureki, and H. Hori, 9th Extremophiles 2012,   2012年09月09日
  • Transfer RNA modifications in thermophilic bacteria
    T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori, 9th Extremophiles 2012,   2012年09月09日
  • 高度好熱菌tRNA中のシュードウリジン55修飾は、温度変化への適応因子として機能する
    冨川千恵,石田一雄,国林貴史,越智杏奈,金井 保,平田 章,岩下知香子,堀 弘幸, 第14回日本RNA学会年会,   2012年07月16日
  • tRNA modifications in Thermoplasma acidophilum
    T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori, 第14回日本RNA学会年会,   2012年07月16日
  • 極小アーキアにおけるtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼの構造機能解析
    平田 章,藤島皓介,山上龍太,河村卓哉,J. F. Banfield,堀 弘幸, 第25回日本アーキア研究会,   2012年07月16日
  • RNA修飾成熟マシナリーの構造と機能
    堀 弘幸, 第3回愛媛大学学術フォーラム,   2012年01月06日, 招待有り
  • サーマス・サーモフィラス由来葉酸依存性tRNA (m5U54) メチル化酵素の基質認識機構
    山上龍太、山下光輝、西増弘志、岩下知香子、平田 章、濡木 理、堀 弘幸, 第34回日本分子生物学会年会,   2011年12月16日
  • 超好熱性古細菌Thermococcus kodakaraensis由来tRNA (m2G10/m22G10) methyltransferase(TK0981)の酵素学的性質の決定
    田村俊浩、平田 章、堀 弘幸, 第34回日本分子生物学会年会,   2011年12月16日
  • Thermus thermophilus tRNA (m1A58) methyltransferase [Trm1]の基質認識メカニズムの解明
    詫間浩之、美濃地真之、牛尾なつみ、冨川千恵、平田 章、堀 弘幸, 第34回日本分子生物学会年会,   2011年12月16日
  • 酵母由来のtRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の機能解析
    西田 裕、岡田和樹、平田 章、堀 弘幸,   2011年12月15日
  • Substrate tRNA recognition mechanism of eubacterial tRNA (m1A58) methyltransferase (TrmI)
    Hiroyuki Takuma, Masayuki Minoji, Natsumi Ushio, Chie Tomikawa, Akira Hirata, Anna Ochi, and Hiroyuki Hori, The 38th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry,   2011年11月09日
  • RNA修飾酵素の触媒機構の多様性とそのネットワークの環境応答
    堀 弘幸, 北海道大学グローバルCOE物質科学イノベーション講演会,   2011年11月08日, 招待有り
  • アーキアRNAポリメラーゼのサブユニットDに見られる特異的ドメイン構造と機能の多様性と進化
    平田 章、堀 弘幸、村上勝彦、Faith H. Lessner、Matthew Jenning、Eduardus C. Duin、Daniel J. Lessner, 第12回極限環境生物学会年会,   2011年11月
  • アーキアにおける2’-5’ RNA ligaseの構造機能解析
    長野倫子、石丸雄基、金井保、平田 章、堀 弘幸, 第12回極限環境生物学会年会,   2011年11月
  • Multisite specific tRNA methyltransferase Trm1 from a hyper-thermophilic eubacterium, Aquifex aeolicus
    T. Awai, A. Ochi, Ihsanawati, T. Sengoku, S. Kimura, C. Tomikawa, T. Yokogawa, A. Hirata, Y. Bessho, T. Suzuki, S. Yokoyama and H. Hori, Thermophiles 2011,   2011年09月12日
  • Relationship between 5-methyluridine modification at position 54 in tRNA and tRNA modification network in Thermus thermophiles
    R. Yamagami, N. Shigi, S.-I. Asai, K. Watanabe, and H. Hori, Thermophiles 2011,   2011年09月12日
  • Transfer RNA modifications in Thermoplasma acidophilum
    T. Kawamura, C. Tomikawa, T. Ohira, Y. Inoue, A. Yamagishi, T. Suzuki, and H. Hori, Thermophiles 2011,   2011年09月12日
  • Recognition and cleavage of intron in precursor tRNA by the splicing endonuclease from Aperopyrum pernix, an aerobic hyper-thermophilic Crenarchaeon, thorough a novel RNA recognition site in Crenarchaea specific loop
    A. Hirata, T. Kitajima, and H. Hori, Thermophiles 2011,   2011年09月12日
  • Structural and functional analyses of archaeal 2’-5’ RNA ligase
    T. Nagano, A. Hirata, Y. Ishimaru, T. Kanai, and H. Hori, Thermophiles 2011,   2011年09月11日
  • 古細菌における2’-5’ RNA ligaseの構造機能解析
    長野 倫子, 平田 章, 石丸 雄基, 金井 保, 堀 弘幸, RNAフロンティアミーティング,   2011年08月30日
  • 酵母由来のtRNA (m2G10) methyltransferase (Trm11-Trm112)の機能解析
    西田 裕、岡田和樹、平田 章、堀 弘幸, RNAフロンティアミーティング,   2011年08月30日
  • Elucidation of substrate tRNA recognition mechanism by tRNA (m1A58) methyltransferase[TrmI] from Thermus thermophiles
    H. Takuma, M. Minoji, N. Ushio, C. Tomikawa, A. Hirata, C. Iwashita, A. Ochi, and H. Hori, 第1回モデル生物丸ごと一匹学会・第10回高度好熱菌連携会議,   2011年08月19日
  • The crystal structure analysis and establishment of activity mesurement system of Thermus thermophilus tRNA(Um34,Cm34) methyltransferase [YibK]
    T. Matsugi, A. Hirata, and H. Hori, 第1回モデル生物丸ごと一匹学会・第10回高度好熱菌連携会議,   2011年08月11日
  • Transfer RNA recognition mechanism of multi-site specific tRNA methyltransferase (Trm1) from Aquifex aeolicus
    T. Awai, A. Ochi, Ihsanawati, A. Hirata, Y. Bessho, S. Yokoyama, and H. Hori, 16th Annual Meeting of RNA Society,   2011年06月16日
  • Regulation of tRNA modification network by pseudouridine 55 in Thermus thermophiles
    C. Tomikawa, K. Ishida, T. Kunibayashi, A. Ochi, T. Kanai, A. Hirata, C. Iwashita, and H. Hori, 16th Annual Meeting of RNA Society,   2011年06月16日
  • Substrate tRNA recognition mechanism of FAD/folate-dependet tRNA m5U54 methyltransferase TrmFO
    R. Yamagami, K. Yamashita, H. Nishimasu, C. Iwashita, A. Hirata, O. Nureki, and H. Hori, 16th Annual Meeting of RNA Society,   2011年06月16日
  • 葉酸依存性tRNAメチル化酵素TrmFOの基質認識メカニズム解明に向けて
    山上龍太、山下光輝、西増弘志、岩下知香子、平田 章、濡木 理、堀 弘幸, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010),   2010年12月17日
  • Thermus thermophilus由来dihydrouridine合成酵素(Dus)の機能解析
    吉田剛士、岩崎絵梨、粟井貴子、冨川千恵、平田 章、堀 弘幸, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010),   2010年12月17日
  • TrmHによる多段階基質tRNA認識と反応機構の解明
    越智杏奈、真壁 幸樹、桑島 邦博、堀 弘幸, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010),   2010年12月17日
  • キサンチン酸化還元酵素の脱水素酵素型, 酸化酵素型の詳細構造解析
    西野朋子, 岡本 研, 川口裕子, 松村智裕, 堀 弘幸, 西野武士, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010),   2010年12月17日, 招待有り
  • アーキア(古細菌)RNAスプライシング酵素の基質特異性の分子メカニズム
    平田 章、北嶋 翼、堀 弘幸, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010),   2010年12月17日
  • 小麦胚芽無細胞タンパク質合成系でプロテインスプライシング反応を用いたRNase CL2発現系の構築
    山内 貴博、岡田 和樹、宗吉 裕樹、横川 隆志、山崎 俊夫、遠藤 弥重太、堀 弘幸, 第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010),   2010年12月17日
  • Reserch for enzymatic reaction mechanism of FAD/Folate dependent tRNA m5U54 methyltransferase TrmFO
    Ryota Yamagami, Koki Yamashita, Hiroshi Nishimasu,Chikako Iwashita, Akira Hirata,Osamu Nureki, Hiroyuki Hori, International Symposium of Protein Island in Matsuyama 2010,   2010年09月
  • Construction of an expression system of RNase CL2 by a wheat germ cell-free translation system coupled with protein splicing reaction
    Takahiro Yamauchi, Kazuki Okada, Yuki Muneyoshi, Takashi Yokogawa, Toshio Yamazaki, Yaeta Endo, and Hiroyuki Hori, International Symposium of Protein Island in Matsuyama 2010, Matsuyama,   2010年09月
  • Thermusthermophilus由来dihydrouridine合成酵素(Dus)の機能解析
    吉田剛士、岩崎絵梨、粟井貴子、冨川千恵、平田 章、堀 弘幸, 第9回高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携会議,   2010年08月21日
  • 葉酸依存性tRNAU54メチル化酵素TrmFOのin vitroアッセイ法の確立
    山上龍太、山下光輝、西増弘志、岩下知香子、平田 章、濡木 理、堀 弘幸, 第9回高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携会議,   2010年08月21日
  • Thermus thermophilus におけるtRNA3次元コア修飾ヌクレオシドの重要性
    冨川千恵、金井 保、横川隆志、堀 弘幸, 第9回高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携会議,   2010年08月21日
  • Network of modified nucleosides and modification enzymes in Thermus thermophilus tRNA
    Chie Tomikawa, Kazuo Ishida, Takashi Kunibayashi, Anna Ochi, Tamotsu Kanai, Takashi Yokogawa, Akira Hirata, Chikako Iwashita, and Hiroyuki Hori, 第9回高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト連携会議,   2010年08月21日, 招待有り
  • 三次元コアを修飾するtRNAメチル化酵素による多段階基質tRNA認識
    越智 杏奈、真壁 幸樹、桑島 邦博、堀 弘幸, 第11回日本RNA学会,   2010年07月28日
  • tRNA (m7G46) methyltransferase[TrmB]触媒反応機構の提案
    冨川 千恵、平田 章、堀 弘幸, 第11回日本RNA学会,   2010年07月27日
  • アーキアRNAスプライシング酵素の基質特異性のメカニズム
    平田 章、北嶋 翼、 真帆、吉成 茂夫、渡邉 洋一、堀 弘幸, 第10回アーキア研究会,   2010年07月09日
  • Crystal structure of a splicing endonuclease from Crenarchaeaon Aeropyrum pernix
    Maho Okuda, Tsubasa Kitajima, Tomoo Shiba, Akira Hirata, Daniel-Ken Inaoka, Kiyoshi Kita, Genji Kurisu, Shigeharu Harada, Hiroyuki Hori, Yoh-ichi Watanabe and Shigeo Yoshinari, RNA Meeting 2010,   2010年06月
  • The lack of tRNA m7G46 modification in Thermus thermophilus causes hypo-modification of other modifications in tRNA and depresses protein synthesis at high temperatures
    C. Tomikawa, T. Yokogawa, T. Kanai, and H. Hori, 第8回科研費特定領域「バイオ操作」公開シンポジウム,   2010年03月10日
  • Atomic structure of a folate/FAD-dependent tRNA T54 methyltransferase
    H. Nishimasu, R. Ishitani, K. Yamashita, C. Iwashita, A. Hirata, H. Hori, and O. Nureki, 23rd tRNA workshop Portugal 2010,   2010年01月28日
  • Characterization of TrmJ [Transfer RNA (Cm32/Um32) Methyltransferase] Ortholog (TK1970) from a Hyperthermophilic Archaeon Thermococcus kodakarensis
    A. Hirata, A. Ochi, C. Tomikawa, T. Kitajima, T. Kanai, and H. Hori, 23rd tRNA workshop Portugal 2010,   2010年01月28日
  • Flexible recognition of methylation target site, guannosine at position 18 in tRNA by tRNA (Gm18) methyltransferase
    A. Ochi, and H. Hori, 23rd tRNA workshop Portugal 2010,   2010年01月28日
  • Multi-site substrate recognition mechanism of Aquifex aeolicus Trm1
    T. Awai, Ihsanawati, S Kimura, C. Tomikawa, A. Ochi, T. Yokogawa, T. Suzuki, Y. Bessho, S. Yokoyama, and H. Hori, 23rd tRNA workshop Portugal 2010,   2010年01月28日
  • Transfer RNA Methyltransferases from a Hyperthermophilic Eubacterium, Aquifex aeolicus
    H. Hori, T. Awai, T. Toyooka, C. Tomikawa, H. Okamoto, H. Takeda, K. Watanabe, A. Ochi, A. Hirata, S. Kimura, Y. Ikeuchi, T. Yokogawa, and T. Suzuki, 23rd tRNA workshop Portugal 2010,   2010年01月28日

受賞

  •   2015年11月, 日本学術振興会, 有意義な審査意見を付していただいた科研費審査委員
  •   2004年07月, 日本生化学会中四国支部, 優秀研究発表賞

競争的資金



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