大学院農学研究科
食料生産学専攻
English
更新日：2025/01/06
准教授
ﾊﾌﾞ　ﾂﾖｼ
羽生　剛

経歴

  1. 京都大学 大学院農学研究科 附属農場助手

学歴

  1. 京都大学2001

学位

  1. 博士（農学）果樹園芸学京都大学2008/03/24

研究分野

  1. 環境・農学園芸科学

研究キーワード

  1. Pomology
  2. 果樹園芸

共同研究・競争的資金等の研究課題

  1. カンキツ果実の裂果における果皮表面の気孔数の影響挑戦的萌芽研究競争的資金
  2. ウンシュウミカンの浮き皮発生程度の品種間差異に関する遺伝的要因の解析基盤研究(C)競争的資金
  3. 京都大学バラ科果樹の低温要求性マスターレギュレーターの制御経路解明と新規休眠制御技術開発基盤研究(B)2018/04/01-2021/03/01
  4. 愛媛大学ウンシュウミカンの浮き皮発生程度の品種間差異に関する遺伝的要因の解析基盤研究(C)2018/04/01-2021/03/01
  5. 山形大学ナシ属果実成熟期に起こるデンプンの蓄積から代謝へのダイナミックな相転換の意義基盤研究(B)2016/04/01-2020/03/01
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論文

  1. The parthenocarpic gene Pat-k is generated by a natural mutation of SlAGL6 affecting fruit development in tomato (Solanum lycopersicum L.)2018/04/27Takisawa R.BMC Plant Biology18/ 110.1186/s12870-018-1285-6URL
  2. The parthenocarpic gene Pat-k is generated by a natural mutation of SlAGL6 affecting fruit development in tomato (Solanum lycopersicum L.).2018/04/27Takisawa Rihito,Nakazaki Tetsuya,Nunome Tsukasa,Fukuoka Hiroyuki,Kataoka Keiko,Saito Hiroki,Habu Tsuyoshi,Kitajima AkiraBMC plant biology18/ 1, 7210.1186/s12870-018-1285-6Parthenocarpy is a desired trait in tomato because it can overcome problems with fruit setting under unfavorable environmental conditions. A parthenocarpic tomato cultivar, 'MPK-1', with a parthenocarpic gene, Pat-k, exhibits stable parthenocarpy that produces few seeds. Because 'MPK-1' produces few seeds, seedlings are propagated inefficiently via cuttings. It was reported that Pat-k is located on chromosome 1. However, the gene had not been isolated and the relationship between the parthenocarpy and low seed set in 'MPK-1' remained unclear. In this study, we isolated Pat-k to clarify the relationship between parthenocarpy and low seed set in 'MPK-1'.Using quantitative trait locus (QTL) analysis for parthenocarpy and seed production, we detected a major QTL for each trait on nearly the same region of the Pat-k locus on chromosome 1. To isolate Pat-k, we performed fine mapping using an F population following the cross between a non-parthenocarpic cultivar, 'Micro-Tom' and 'MPK-1'. The results showed that Pat-k was located in the 529 kb interval between two markers, where 60 genes exist. By using data from a whole genome re-sequencing and genome sequence analysis of 'MPK-1', we could identify that the SlAGAMOUS-LIKE 6 (SlAGL6) gene of 'MPK-1' was mutated by a retrotransposon insertion. The transcript level of SlAGL6 was significantly lower in ovaries of 'MPK-1' than a non-parthenocarpic cultivar. From these results, we could conclude that Pat-k is SlAGL6, and its down-regulation in 'MPK-1' causes parthenocarpy and low seed set. In addition, we observed abnormal micropyles only in plants homozygous for the 'MPK-1' allele at the Pat-k/SlAGL6 locus. This result suggests that Pat-k/SlAGL6 is also related to ovule formation and that the low seed set in 'MPK-1' is likely caused by abnormal ovule formation through down-regulation of Pat-k/SlAGL6.Pat-k is identical to SlAGL6, and its down-regulation causes parthenocarpy and low seed set in 'MPK-1'. Moreover, down-regulation of Pat-k/SlAGL6 could cause abnormal ovule formation, leading to a reduction in the number of seeds.
  3. Identification of RAN1 orthologue associated with sex determination through whole genome sequencing analysis in fig (Ficus carica L.).2017/01/25Mori Kazuki,Shirasawa Kenta,Nogata Hitoshi,Hirata Chiharu,Tashiro Kosuke,Habu Tsuyoshi,Kim Sangwan,Himeno Shuichi,Kuhara Satoru,Ikegami HidetoshiScientific reports7, 4112410.1038/srep41124With the aim of identifying sex determinants of fig, we generated the first draft genome sequence of fig and conducted the subsequent analyses. Linkage analysis with a high-density genetic map established by a restriction-site associated sequencing technique, and genome-wide association study followed by whole-genome resequencing analysis identified two missense mutations in RESPONSIVE-TO-ANTAGONIST1 (RAN1) orthologue encoding copper-transporting ATPase completely associated with sex phenotypes of investigated figs. This result suggests that RAN1 is a possible sex determinant candidate in the fig genome. The genomic resources and genetic findings obtained in this study can contribute to general understanding of Ficus species and provide an insight into fig's and plant's sex determination system.
  4. カンキツの早期生理落果における果実の離脱誘導と離脱特性2017李 曦, 北島 宣, 羽生 剛, 片岡 圭子, 滝沢 理仁, 中崎 鉄也The Horticulture Journal86/ 1, 11-18URL一般社団法人　園芸学会<p>カンキツにおいて，採取果実の寒天挿しにより果実の離脱を誘導する新たな方法を開発した．この方法により，ウンシュウミカン，'清見'，ヒュウガナツ，ポンカンの早期生理落果における果実の離脱特性を明らかにした．一次生理落果において，採取果実の離脱はヒュウガナツで早く，ウンシュウミカンとポンカンで遅く，'清見'は中間であり，三つの型に分けられた．これら 4 種・品種の 96 時間後における累積離脱率は 80％以上となった．一方，二次生理落果における果実の離脱開始はヒュウガナツが最も早く，ウンシュウミカンが最も遅かったものの，累積離脱率はポンカンで 84％と最も高く，ウンシュウミカンで 6％と最も低かった．これらの種・品種における一次生理落果と二次生理落果の離脱パターンは異なった．高温条件はウンシュウミカンとポンカンの採取果実の離脱を促進した．2012 年の開花 7 週間後採取の'清見'，ヒュウガナツ，ポンカン果実，2013 年の開花 5 週間後採取のポンカン果実で葉を着けて寒天挿しを行うと離脱が抑制された．早期生理落果における採取した子房および果実の寒天挿しにより，4 種・品種の子房および果実の離脱特性が明らかになった．</p>
  5. カキ'平核無'由来小果変異系統'突核無'の果実における生理的特性と遺伝子発現の差異2016羽生 剛, 山根 久代, 内藤 一平, 西山 総一郎, 野中 亜優美, 河井 崇, 山田 寿, 田尾 龍太郎The Horticulture Journal85/ 4, 306-314URL一般社団法人　園芸学会<p>カキ'突核無'は'平核無'由来の枝変わり系統であり，小型の果実を着ける．'突核無'の小果表現型を特徴付けるため，本研究では組織学的解析と植物成長調節剤処理，次世代シークエンシングを用いたトランスクリプトーム解析を行った．'突核無'果実における柔細胞の細胞数は'平核無'よりも有意に少なく，さらに果実発育期後半における細胞サイズも有意に小さかった．一方，'突核無'の果実サイズはサイトカイニン処理［N-(2-chloro-4-pyridyl)-N'-phenylurea (CPPU), 50 or 200 ppm］により回復した．これらの結果は，'突核無'果実におけるサイトカイニン活性の低下が果実発育期前半における低い細胞分裂活性と果実発育期後半における低い細胞肥大活性に影響を及ぼしたことを示唆している．そこで，'突核無'と'平核無'の遺伝子発現の差異を明らかにするため，次世代シークエンシングを用いた大規模トランスクリプトーム解析を行った．イルミナ HiSeq2000 による 100 ベースのペアエンドシークエンシングとその後の前処理により，'平核無'からは 21,662,190 リード対，'突核無'からは 23,195,203 リード対を得た．アセンブル後，118,985 個の unigene が得られ，それらの unigene 長は 201～11,954 ベースの範囲であり，平均 unigene 長は 915 ベースであった．デジタル発現解析の結果，164 個の unigene が'突核無'より'平核無'で発現が有意に高く，265 個の unigene が'平核無'より'突核無'で発現が有意に高かった．PAGE 解析の結果，'突核無'では cell cycle や regulation of cell cycle に含まれる遺伝子の発現が有意に低下していた．細胞分裂に関連した発現変動遺伝子には D3-type cyclin と Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase（MAPKKK）が含まれていた．これらの結果から'突核無'の小果表現型の制御に細胞分裂関連遺伝子が関与している可能性について考察した．</p>
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担当授業科目

  1. 2024新入生セミナーA
  2. 2024新入生セミナーB
  3. 2024農学入門
  4. 2024生命の不思議
  5. 2024農学入門
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